1.按所运货物不同，可分为普通货物运输合同，危险货物运输合同与鲜活货物运输合同;
2.按运输过程中运输部门是否有协作关系可分为一般货物运输合同与联运货物运输合同。
3.按运输方式的不同可以分为：铁路货物运输合同，公路货物运输合同，水路货物运输合同，航空货物运输合同与管道货物运输合同。这是常见的划分货物运输合同的标准，下面简单介绍铁路运输合同与水路货物运输合同：
(1)铁路货物运输合同，是指铁路货物运输的托运入与经营铁路运输企业签订明确双方权利义务关系的货物运输的协议。承远方由从事铁路运输的企业担任。
(2)水路货物运输合同是指在水路货运中，承运人与托运人为确定双方权利义务关系的协议。水路货物运输合同的主要内容是承运人应使用自己的船舶，通过确定的航线把托运入的货物运到一定地点，交付给收货人，而托运人应支付承运人规定的运费。
以上各类货物运输合同虽各具特色，但合同的订立、履行、合同的变更与解除、双方当事人主要的权利、义务与责任，以及为社会主义社会的生产和为市场经济服务的目的等内容，却是相同的。
目前，我国调整货物运输合同关系的法律，除经济合同法外，还有《铁路货物运输合同实施细则》、《公路货物运输合同实施细则》、《水路货物运输合同实施细则》、《航空货物运输合同实施细则》以及铁路、汽车和水路的货物运输等法规、规章。它们规定了货物运输合同的基本原则，当事人的权利、义务及违约责任，可以有效地保护当事人的合法权益。
